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DSP/BIOS内核的应用程序中，优先级从低到高有四个线程：
后台线程（IDL）线程；
TSK（任务）线程；
SWI线程（软件中断）；
HWI线程（硬件中断）；
应用程序从默认进入点_c_int00开始运行，首先完成系统的初始化，包括DSP/BIOS配置中指定的各个寄存器的设置以及PLL倍频时钟的设置等，然后调用main()函数，在main()函数结束返回，调用BIOS_start()，开始按优先级检测并执行HWI，SWI，TSK，当前面所有线程都没有执行时（没有HWI和SWI，有的任务已经完成，而有的被挂起），开始进入IDL_F_LOOP循环，执行后台的IDL线程（LOG模块的信息显示就是在IDL线程中完成的，CPU负荷图的数据也是这时读取并送到PC主机，以便完成图形绘制等）。在IDL_F_LOOP中，若有HWI，则立即暂停IDL，切换到硬件中断服务子程序。当硬件ISR完成后，根据具体情况判定有无SWI或唤醒任务，最后才回到IDL继续运行。
注意，DSP/BIOS内核仍然是个多任务的内核，但并不是一个严格意义上的抢先式内核。除了HWI，其他所有线程都必须自己自动放弃对CPU的控制，以便完成切换。当然，当硬件中断发生后，也会产生线程的切换，这时所有线程都将按优先级重新安排运行，所以从这点讲，DSP/BIOS内核也具有抢先的特点。
在DSP/BIOS内核应用中，用户可以将自己的处理代码（如G723的编码、解码，MP3 解压等）放到硬件中断，软件中断，任务或后台线程中的任何一个线程中调用运行。一般推荐在SWI和TSK中调用。用户可以在DSP/BIOS的配置文件中简单说明这些软件中断或任务（即所谓的静态说明），也可以在运行过程中通过DSP/BIOS内核提供的API函数调用动态创建。
API函数调用几乎都可以使用C或C++语言直接调用。通过这些API，用户可以完成硬件中断的管理，软件中断的启动，任务的切换，各线程之间的同步和数据通信等。