1、指令集：M0内核只有56条指令，其中50条是16位的，相对于M3内核来说，指令集更简单，因此可以更快地掌握整个指令集。而M3内核执行Thumb®-2指令集，以获得最佳性能和代码大小，包括硬件除法、单周期乘法和位字段操作。
2、连接性：M0内核为低能耗连接设计，支持Bluetooth Low Energy、IEEE 802.15和Z-wave等，在模拟设备中增加数字功能，以有效地预处理和传输数据。而M3内核没有特别强调连接性。
3、价格：M0内核更小，所以价格更便宜。
综上所述，M0内核在指令集、连接性和价格方面有优势，而M3内核在性能、功能和全功能方面更优越。选择哪种内核取决于具体应用的需求和性能要求。