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楼主的问题问得很大呀，虽然较初级，却也难回答，但愿对你有些帮助。主要是一些概念的理解。
1. 交叉工具链是一套编译系统，包含了编译、链接、make工具，以及某种libc。我们用它来编译源代码，形成目标机上的可执行文件或者是库。之所以叫“交叉”，是因为这个工具链不是生成HOST（intel x86）上的目标码，生成的是目标机（你的arm）的目标码。最终你与交叉编译器打交道的方式应该是设置好CPU类型，建立相应环境变量，并使用make进行工程生成，可能要自己修改或者编写makefile。
2. U-BOOT是一个由GNU组织开发的启动程序，可在ARM，MIPS，PPC等目标机下使用。你要做的是选择一个与你的板子相近的配置模版（include/configs里面有很多中板卡的配置），进行修改，称为你自己的板子的配置，编译生成uboot的bin或者hex文件，烧写到目标板的flash里面，并最终使它可运行并加载一个linux内核。
3. 内核裁减主要通过修改配置文件来进行，一般分为内核功能定制和根文件系统的移植。但具体要做成什么样，有哪些功能，则根据你的需要来决定，不能一概而论。
4. 把这些准备好以后，结果应该是你的板子可以启动并运行linux操作系统了，然后你再选择某种GUI进行移植，比如minigui等。

啊，看来你是使用denx的eldk，这个可是好东东，dnex的网站上有一个叫做DULG的文档，你可以弄来看看，应该会有很多帮助。另外，这方面的书也不少，可以买来看看。

谢谢老大了，虽然有蛮多不清楚。我先看着。再来讨教。谢谢。