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首先linux还不能跟wince对应，应该是跟android对应。
刚毕业的时候搞过一段时间的lunix,对于一些命令，也makefile的写法，很是下了不少工夫，可后来没有机会做了，基本上都忘记了。
先说一下嵌入式系统中两者相似之处：
1.对于一般的开发者来说（android/wince）BSP是提供好的（国内99%的都是使用修改，而不是做自己写BSP.我就知道一家开发BSP的，连联想都是使用）。
我们需要什么就修改一下。开发的难度跟你的BSP提供商的支持有关系，跟你的硬件改变有关系，跟你使用的外设（WIFI,battery等等）有关系，跟你的系统要求有关系。
2.开发环境，都需要安装特殊的build工具。安装起来那个都不是很容易，但是也不是很难。
3.build的方法，都是有一些命令完成的。
4.Image的下载，USB、internet都是可以的直接烧写硬件也可以的。
5.调试方法，串口输出信息最为常见。
6.驱动开发，都是使用c的。
7.image在硬件的启动都是可以分为eboot+OS的方式。
不同之处：
1.对于BSP来说，wince可以不提供给自己的客户，但是linux却要求给。
2.开发环境wince,有IDE和命令行，linux一般只有命令行。linux可以自己编译使用的交叉编译工具，而wince使用的只是微软提供给我们的接口。
3.BSP的结构，2者都有自己的结构，比如，往系统中添加驱动，两者就是加到不同的位置和次数。