可能的原因是由于外部脉冲频率高于定时器的计数能力导致的溢出。在外部捕获模式下，定时器的计数器（CNT寄存器）会根据外部信号的脉冲来计数，而捕获寄存器（CAP寄存器）则用于保存外部信号触发的捕获时间。如果外部信号的频率超过了定时器的计数能力，那么计数器和捕获寄存器的值就会变得非常大。

在事件计数模式下，定时器的计数器（CNT寄存器）会根据定时器内部的时钟来计数，不受外部信号频率的影响。因此，在相同的外部信号频率下，事件计数模式下的CNT值应该更准确。

要解决这个问题，可以考虑调整定时器的时钟源分频系数、计数模式和捕获模式的参数，从而使其能够适应外部信号的频率。另外，还可以考虑增加定时器的位数（比如从16位扩展为32位）来增大定时器的计数能力。也可以试试 把timer 3的clock source选到1M试看看。