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在将程序运行在SPI闪存（spiflash）上时，相比于内部闪存，速度慢100倍的原因通常有几个可能的解释。

1. 存取速度：SPI闪存与内部闪存的存取速度不同。SPI闪存通过SPI接口进行访问，相比于内部闪存，它需要更多的时钟周期和额外的通信开销来完成读写操作，因此速度较慢。

2. SPI闪存与处理器之间的通信带宽：SPI闪存和处理器之间的通信带宽相对较低。不同于内部闪存与处理器之间直接的高速总线连接，SPI闪存的通信速率较低，可能成为程序运行慢的瓶颈。

3. 内存访问速度：SPI闪存中的程序代码需要加载到内存中，然后再被处理器执行。相比之下，内部闪存通常直接与处理器相连，无需复制代码，因此内部闪存的访问速度会更快。

4. 缓存失效：正如您提到的，无论是否开启缓存（cache），程序在SPI闪存上运行的速度都是相同的。这可能是因为处理器的缓存不适用于SPI闪存，因此无法提高其访问速度。

基于以上原因，将程序运行在SPI闪存上会导致较慢的执行速度。如果您希望加快程序的执行速度，可以考虑将程序代码迁移到内部闪存中，以提高存取速度和通信带宽。