是有区别的，4000E和4000X基本上是同一时期推出的，他们与4000一样都属于4000系列，它们与4000相比主要在以下几个方面有了改进：1、系统时钟的速率提高；2、容量更大了；3、采用了更新的结构设计；4、增加了Select-RAM。
4000E的管脚和Bit-Stream文件是兼容4000的，因此原为4000的器件可以很容易地升级到4000E，但是原为4000E的器件不能改用4000。
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